Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrpraQ9DBG7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms