Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Smg9Q9DB90 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smg9Q9DB90 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms