Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fundc1Q9DB70 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms