Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA17

Tsga13, Testis-specific gene 13 protein, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsga13Q9DA17 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsga13Q9DA17 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsga13Q9DA17 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsga13Q9DA17 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsga13Q9DA17 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsga13Q9DA17 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsga13Q9DA17 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsga13Q9DA17 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsga13Q9DA17 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsga13Q9DA17 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsga13Q9DA17 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsga13Q9DA17 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsga13Q9DA17 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsga13Q9DA17 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsga13Q9DA17 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsga13Q9DA17 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsga13Q9DA17 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tsga13Q9DA17 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsga13Q9DA17 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms