Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34b2Q9D9N2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms