Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdzd9Q9D9M4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdzd9Q9D9M4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
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