Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9L5

Actrt2, Actin-related protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt2Q9D9L5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actrt2Q9D9L5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Actrt2Q9D9L5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms