Protein–RNA interactions for Protein: Q9D979

Uncharacterized protein C17orf64 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D979 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D979 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D979 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D979 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D979 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D979 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D979 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D979 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D979 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D979 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D979 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D979 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D979 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D979 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D979 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D979 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D979 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D979 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D979 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D979 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D979 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D979 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D979 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D979 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9D979 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9D979 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9D979 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D979 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D979 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D979 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D979 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D979 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D979 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D979 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D979 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D979 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D979 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D979 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D979 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D979 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D979 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D979 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D979 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D979 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D979 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D979 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D979 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D979 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D979 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D979 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D979 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D979 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D979 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D979 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D979 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D979 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D979 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D979 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D979 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D979 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D979 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D979 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D979 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D979 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D979 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D979 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D979 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D979 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D979 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D979 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D979 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D979 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D979 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D979 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D979 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D979 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D979 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D979 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D979 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D979 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D979 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D979 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D979 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D979 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D979 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D979 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D979 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D979 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D979 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D979 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D979 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D979 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D979 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D979 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D979 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D979 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D979 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D979 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D979 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D979 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms