Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8V0

Hm13, Minor histocompatibility antigen H13, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hm13Q9D8V0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Hm13Q9D8V0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hm13Q9D8V0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms