Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T2

Gsdmdc1, Gasdermin-D, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsdmdc1Q9D8T2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gsdmdc1Q9D8T2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms