Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L5

Ccdc91, Coiled-coil domain-containing protein 91, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc91Q9D8L5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc91Q9D8L5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc91Q9D8L5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc91Q9D8L5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc91Q9D8L5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc91Q9D8L5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc91Q9D8L5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc91Q9D8L5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc91Q9D8L5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc91Q9D8L5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc91Q9D8L5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc91Q9D8L5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc91Q9D8L5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc91Q9D8L5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc91Q9D8L5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc91Q9D8L5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms