Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp4bQ9D8B3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms