Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmigd1Q9D7L8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.7 ms