Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J9

Echdc3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc3Q9D7J9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Echdc3Q9D7J9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Echdc3Q9D7J9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Echdc3Q9D7J9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Echdc3Q9D7J9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Echdc3Q9D7J9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Echdc3Q9D7J9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Echdc3Q9D7J9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Echdc3Q9D7J9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Echdc3Q9D7J9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Echdc3Q9D7J9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Echdc3Q9D7J9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Echdc3Q9D7J9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Echdc3Q9D7J9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Echdc3Q9D7J9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Echdc3Q9D7J9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Echdc3Q9D7J9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Echdc3Q9D7J9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Echdc3Q9D7J9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Echdc3Q9D7J9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Echdc3Q9D7J9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Echdc3Q9D7J9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Echdc3Q9D7J9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Echdc3Q9D7J9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Echdc3Q9D7J9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Echdc3Q9D7J9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Echdc3Q9D7J9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Echdc3Q9D7J9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Echdc3Q9D7J9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Echdc3Q9D7J9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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