Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D7E4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D7E4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9D7E4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9D7E4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9D7E4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9D7E4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9D7E4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Q9D7E4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms