Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn23Q9D7D7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn23Q9D7D7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms