Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Srp19Q9D7A6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Srp19Q9D7A6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Srp19Q9D7A6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Srp19Q9D7A6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Srp19Q9D7A6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Srp19Q9D7A6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Srp19Q9D7A6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Srp19Q9D7A6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Srp19Q9D7A6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Srp19Q9D7A6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srp19Q9D7A6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Srp19Q9D7A6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Srp19Q9D7A6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Srp19Q9D7A6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Srp19Q9D7A6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Srp19Q9D7A6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Srp19Q9D7A6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp19Q9D7A6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp19Q9D7A6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp19Q9D7A6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp19Q9D7A6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp19Q9D7A6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp19Q9D7A6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp19Q9D7A6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp19Q9D7A6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp19Q9D7A6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp19Q9D7A6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp19Q9D7A6 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Srp19Q9D7A6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Srp19Q9D7A6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Srp19Q9D7A6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms