Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfsf13Q9D777 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms