Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nop56Q9D6Z1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop56Q9D6Z1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms