Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc3Q9D6Y1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms