Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tube1Q9D6T1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms