Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sec23bQ9D662 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec23bQ9D662 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms