Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
4930564D02RikQ9D4S4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms