Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms