Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Syce1Q9D495 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syce1Q9D495 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms