Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D454 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D454 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D454 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D454 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D454 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D454 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D454 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D454 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D454 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D454 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D454 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D454 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D454 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D454 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D454 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D454 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D454 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D454 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D454 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D454 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D454 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D454 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D454 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D454 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D454 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D454 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D454 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D454 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D454 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D454 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D454 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D454 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D454 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D454 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D454 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D454 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D454 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D454 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D454 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D454 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D454 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D454 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D454 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D454 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D454 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D454 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D454 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D454 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D454 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D454 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D454 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D454 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D454 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D454 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D454 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D454 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D454 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D454 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D454 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D454 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D454 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D454 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D454 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D454 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D454 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D454 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D454 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D454 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D454 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D454 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D454 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D454 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D454 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D454 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D454 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D454 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D454 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D454 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D454 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D454 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D454 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D454 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D454 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D454 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D454 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D454 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D454 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D454 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D454 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D454 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D454 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9D454 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9D454 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9D454 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D454 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D454 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D454 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D454 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D454 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms