Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pus10Q9D3U0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pus10Q9D3U0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms