Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

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Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Krt20Q9D312 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Krt20Q9D312 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Krt20Q9D312 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
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Krt20Q9D312 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt20Q9D312 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms