Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vsig1Q9D2J4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vsig1Q9D2J4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms