Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pramef12Q9D2F1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pramef12Q9D2F1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms