Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trappc6bQ9D289 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc6bQ9D289 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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