Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D1F3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D1F3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D1F3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D1F3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D1F3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D1F3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D1F3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D1F3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D1F3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D1F3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D1F3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D1F3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D1F3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D1F3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D1F3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D1F3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D1F3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D1F3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D1F3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D1F3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D1F3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D1F3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D1F3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D1F3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D1F3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D1F3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D1F3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D1F3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D1F3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D1F3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D1F3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D1F3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D1F3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D1F3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D1F3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D1F3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D1F3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D1F3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D1F3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D1F3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D1F3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D1F3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D1F3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D1F3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D1F3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D1F3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D1F3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D1F3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D1F3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D1F3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D1F3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D1F3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D1F3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D1F3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D1F3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms