Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C8

Vps28, Vacuolar protein sorting-associated protein 28 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps28Q9D1C8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vps28Q9D1C8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps28Q9D1C8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps28Q9D1C8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms