Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Mrpl28Q9D1B9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mrpl28Q9D1B9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Mrpl28Q9D1B9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Mrpl28Q9D1B9 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Mrpl28Q9D1B9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Mrpl28Q9D1B9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Mrpl28Q9D1B9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Mrpl28Q9D1B9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Mrpl28Q9D1B9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Mrpl28Q9D1B9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl28Q9D1B9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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