Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Hddc3Q9D114 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hddc3Q9D114 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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