Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Zbed3Q9D0L1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Zbed3Q9D0L1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbed3Q9D0L1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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