Protein–RNA interactions for Protein: Q9D083

Spc24, Kinetochore protein Spc24, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc24Q9D083 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spc24Q9D083 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spc24Q9D083 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spc24Q9D083 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spc24Q9D083 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spc24Q9D083 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spc24Q9D083 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spc24Q9D083 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spc24Q9D083 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spc24Q9D083 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spc24Q9D083 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spc24Q9D083 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spc24Q9D083 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spc24Q9D083 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Spc24Q9D083 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spc24Q9D083 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spc24Q9D083 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spc24Q9D083 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spc24Q9D083 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spc24Q9D083 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spc24Q9D083 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Spc24Q9D083 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spc24Q9D083 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spc24Q9D083 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spc24Q9D083 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spc24Q9D083 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spc24Q9D083 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spc24Q9D083 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spc24Q9D083 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spc24Q9D083 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spc24Q9D083 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spc24Q9D083 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spc24Q9D083 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spc24Q9D083 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spc24Q9D083 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spc24Q9D083 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Spc24Q9D083 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spc24Q9D083 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms