Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Shmt2Q9CZN7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms