Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc77Q9CZH8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms