Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ChtopQ9CY57 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms