Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ube2fQ9CY34 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube2fQ9CY34 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms