Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Xrcc3Q9CXE6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms