Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX30

Yif1b, Protein YIF1B, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yif1bQ9CX30 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Yif1bQ9CX30 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms