Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cxxc1Q9CWW7 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms