Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pin4Q9CWW6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pin4Q9CWW6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms