Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prkrip1Q9CWV6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkrip1Q9CWV6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms