Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CWU4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CWU4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CWU4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CWU4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CWU4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CWU4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CWU4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CWU4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms