Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tdrd12Q9CWU0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms