Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ddx28Q9CWT6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.05■□□□□ 0
Ddx28Q9CWT6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ddx28Q9CWT6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ddx28Q9CWT6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ddx28Q9CWT6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ddx28Q9CWT6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ddx28Q9CWT6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ddx28Q9CWT6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ddx28Q9CWT6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms