Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cnot11Q9CWN7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cnot11Q9CWN7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms